يهدف برنامج الدراسات العليا في القسم إلى المساهمة في لعب دورا فعالا في إجراء البحوث المتقدمة فيما يتعلق بإدارة مختلف المشاريع الهندسية، ومن أهم هذه الأهداف مايأتى: 

1. تأهيل الطلبة للحصول على درجة الإجازة العالية (الماجستير) في إدارة المشاريع الهندسية لمختلف التخصصات الهندسية.

2. ان يلعب دورا فاعلا في إجراء البحوث المتقدمة بإدارة مختلف المشاريع الهندسية، ويهدف البرنامج إلى إحداث تغيرات جوهرية في أساليب الإدارة الهندسية والتطوير الشامل لسبل البحث، بالتعاون مع مختلف المؤسسات الصناعية وذلك بتنظيم الندوات والبرامج التدريبية ليحقق بذلك أهداف فرعية من أهمها :

·      تأهيل المهندسين لتبؤ مراكز قيادية في إدارة مختلف المشاريع الهندسية.

·      المساهمة في تطوير قدرات المهندسين في ما يتعلق بإدارة المشاريع في لـيبـيا وذلك ضمن برامج التعليم المستمر.

·      تبادل الخبرات والمعلومات مع الجهات ذات العلاقة داخل لـيبـيا وخارجها 

3. تلبية حاجة لـيبـيا إلى تخصصات أكثر دقة ضمن نطاق الإدارة الهندسية من خلال فتح شعب تخصصية داخل القسم ، وهذا ما قام به القسم مؤخرا حيث استحدث وبدعم من مدرسة العلوم التطبيقية والهندسية بالأكاديمية شعبة إدارة مشاريع التشيد في خريف 2007م وذلك لتلبية مستلزمات النهضة المتسارعة في حقل الصناعة الإنشائية في مجالات المشاريع الإسكانية والطرق ومشاريع الخدمات العامة وغيرها التي تشهدها دولـة لـيبـيا في هذه المرحلة ، وفى مقدمة هذه المستلزمات هو تأمين وتهيئة الكادر البشري القيادي المتمكن والمؤهل لتنفيذ هذه المشاريع الإنشائية وعلى أسس عملية صحيحة ، وهناك طموح فتح شعب تخصصية أخرى في القسم في المستقبل المنظور وربما مع أقسام أخرى بالأكاديمية وعلى سبيل المثال وليس الحصر: 

·  شعبة الإدارة الصناعية.                                       

. شعبة إدارة الجودة.

4.    النظرة المستقبلية للقسم في توفير الفرص للطالب وذلك للحصول على درجة الدراسات العليا للإجازة الدقيقة (الدكتوراه) في اختصاصات القسم، والتخصصات المتاحة:

·    ادارة المشاريع الهندسية.

.  ادارة المشاريع الانشائية.